یکی از جالب‌ترین جنبه‌های فرگشت، تکامل چشم‌ها در موجودات زنده است. چشم‌ها به عنوان یکی از پیچیده‌ترین اندام‌ها، نمونه‌ای عالی از نحوه‌ی سازگاری موجودات با محیط های مختلف هستند. فرگشت چشم‌ها نه تنها نشان‌دهنده‌ی قدرت انتخاب طبیعی است، بلکه تنوع چشم‌گیر در طراحی و عملکرد چشم‌ها در گونه‌های مختلف را نیز به نمایش می‌گذارد.
آغاز فرگشت چشم‌ها
فرگشت چشم‌ها احتمالاً حدود ۶۰۰ میلیون سال پیش آغاز شد. اولین چشم‌ها بسیار ساده بودند و تنها قادر به تشخیص نور از تاریکی بودند. این توانایی ابتدایی برای موجودات زنده مزیت بزرگی محسوب می‌شد، زیرا به آن‌ها اجازه می‌داد تا از شکارچیان فرار کنند یا طعمه‌های خود را پیدا کنند. با گذشت زمان، چشم‌ها به تدریج پیچیده‌تر شدند و توانایی تشخیص شکل‌ها، رنگ‌ها و حتی حرکت را به دست آوردند.
تنوع چشم‌ها در طبیعت